Penentuan Barcode DNA Berdasarkan Lokus Gen rbcL Pada Zingiber Loerzingii Valeton

Sagala, Ladiez Rahmayani (2021) Penentuan Barcode DNA Berdasarkan Lokus Gen rbcL Pada Zingiber Loerzingii Valeton. Skripsi thesis, Universitas Islam Negeri Sumatera Utara.

[img]
Preview
Text
SKRIPSI LADIEZ.pdf

Download (4MB) | Preview

Abstract

Barcode DNA merupakan salah satu tenik molekuler yang digunakan untuk mengidentifikasi dan mengklasifikasi makhluk hidup. Zingiber loerzingii Val. adalah salah satu tumbuhan langka dan endemik yang hanya terdapat di Sumatera Utara. Pengkajian ilmiah mengenai Z. loerzingii masih sangat sedikit yang sudah dilakukan sehingga informasi mengenai tumbuhan ini terbatas sementara identitas yang jelas pada suatu tumbuhan benar-benar diperlukan untuk dapat dimanfaatkan secara maksimal. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik molekuler Z. loerzingii dengan menggunakan barcode DNA serta mengkaji hubungan filogenetiknya berdasarkan lokus gen rbcL. DNA diisolasi dengan kit komersial. Lokus gen rbcL pada genom kloroplas Z. loerzingii diamplifikasi dengan teknik Polymerase Chain Reaction menghasilkan amplikon dengan panjang  600 bp. Penyatuan sekuens konsensus menghasilkan sekuens dengan panjang 576 bp. Rekonstruksi pohon filogenetik dilakukan dengan menggunakan metode Neighbor-Joining dan model perhitungan Kimura-2-Parameter menunjukkan Z. loerzingii termasuk dalam kelompok monofiletik dengan Zingiber zerumbet dan Zingiber officinale sebagai sister taxa. Hasil analisis keragaman molekuler Z. loerzingii menunjukkan bahwa pada seluruh sampel Z. loerzingii yang dikoleksi dari Cagar Alam Sibolangit tidak ada keragaman molekuler atau keragaman genetik. Dengan demikian dapat disimpulkan bahwa barcode DNA dengan lokus gen rbcL dapat digunakan sebagai metode untuk mengidentifikasi Z. loerzingii secara molekuler serta efisien dalam menentukan hubungan kekerabatannya dengan spesies lain.

Jenis Item: Skripsi (Skripsi)
Uncontrolled Keywords: Barcode DNA, Zingiber loerzingii, rbcL
Subjects: 500 Natural sciences and mathematics > 570 Life sciences > 574 Biology
Divisions: Fakultas Sains dan Teknologi > Biologi > Skripsi
Pengguna yang mendeposit: Ms Nurul Hidayah Siregar
Date Deposited: 27 Jan 2022 07:40
Last Modified: 27 Jan 2022 07:40
URI: http://repository.uinsu.ac.id/id/eprint/13467

Actions (login required)

View Item View Item